1、“.....但是，实际上生物体内的微卫星序列并不能无限延长。种间交叉比较表明，它们在长时间的进化过程中都是保守的，其长度可以维持在定的范围内。有些研究者推测这种现象可能与物种所承受的进化压力有关。但也有人认为这种现象与进化压力没有直接的关系，而是微卫星序列的本身属性。还有人认为微卫星序列的长度及其分布是微卫星序列的复制滑移和随机点突变在进化过程中的共同作用的结果。二者通常在基因组中处于种平衡状态。目前的研究发现，进化过程中不同物种的错配修复系统有差异，它们对不同序列类型的错配有着不同的修复效率，这可能就是造成不同物种中不同微卫星序列的丰度各不相同的主要原因。此外，微卫星序列可能在卫星序列的最初形成具有重要的作用，有些微卫星序列甚至还作为小卫星序列基本单位的组成部分。简单重复序列的分类简单重复序列......”。

2、“.....二型，三型如，四型如，五型如，六型如，其中代表重复的次数。根据简单重复序列的结构，将其分为类，即完全的不完全的和复合的简单重复序列。完全的简单重复序列是指由连续的重复单元构成的简单重复序列不完全的简单重复序列是指重复序列中间有个以下的非重复碱基，两侧连续的重复单元重复数大于复合的简单重复序列则指两类或两类以上的串联重复单位由个连续的非重复的碱基分隔开，但连续的重复单元的重复数不小于。在各种真核生物的基因组序列中普遍存在，而且它的分布是随机的，大约每隔就存在个。既可以存在于内含子中，也可以存在于外显子中。在不同的生物体间的数量重复次数重复单位拷贝数变异及染色体分布等有很大的差别。简单重复序列产生的机制域的分布基本相同。而以上组病毒基因组在进化树中的树枝距离也相对较短，亲缘关系近......”。

3、“.....显而易见在这区域分布非常相似。毕业设计论文年月日设计论文题目烟草花叶病毒中的分布及其特征分析学生姓名学生学号专业班级生物技术班学院名称生物学院指导老师湖南大学毕业设计论文第页烟草花叶病毒中的分布及其特征分析摘要本文以种烟草花叶病毒基因组序列作为研究材料，利用软件对各个基因组序列中的的分布结构类型丰度密度及最长序列等进行了系统分析，并基于数据，对种烟草花叶病毒进行亲缘关系分析。结果表明基因组中的丰度与基因组的大小及含量没有必然的关系。各个基因组中单核苷酸，二核苷酸以及三核苷酸重复的相对丰度明显高于四核苷酸五核苷酸和六核苷酸，重复类型也是如此。在各个病毒基因组标记出的序列，基因组大小以及含量也与它们之间的亲缘性紧密相连。通过分析希望能够为研究烟草花叶病毒的变异情况及生物遗传多样性研究提供相关参考......”。

4、“.....以及信息理论和计算机技术的不断发展而逐渐形成的。在过去的十几年中人类对生物信息学，特别是和人类基因序列的研究取得了长足的发展。海量序列的测试完成和发布使人们可以利用计算机技术对包括和蛋白质等生物序列进行分析。生物信息学用信息处理技术研究和蛋白质的性质和相互作用，是当前最为活跃而重要的信息科学与生命科学的交叉学科之面对浩瀚的序列数据，用计算机实现高精度的基因组序列标注，是生物信息学核心问题之基因组序列标注算法是研制基因组序列标注软件进而对浩瀚的己测序序列数据进行基因组标注的前提和基础本文对此进行了深入的分析和研究，提出和实现了基因组序列标注的三类基本问题的五种新算法。作为门交叉学科，生物信息学包含了生物信息的处理存储分发分析和解释在内的所有方面......”。

5、“.....来阐明和理解大量数据所包含的生物意义微卫星是基因组中广泛存在的种简单重复序列，具有高度的多态性，被广泛应用于分子标记亲子鉴定种群遗传研究等领域，有的还与基因功能和些遗传性疾病有关。作为种重要的基因组组分，其进化研究是基因组进化研究领域的个热点。简单重复序列简单重复序列概念简单序列重复简称。又称微卫星，它是由几个核苷酸构成的段片段。它们普遍存在和随机分布于大多数真核生物的基因组中，重复数具有高频率的变异。对的研究始于动物基因组，最早发现的是由重复多次构成的段。在人类基因组中二核苷酸多达个，的大小在之间，三核苷酸四核苷酸也广泛存在于人类基因组中。简单重复序列的起源与进化关于微卫星序列的起源，般认为是由原微卫星序列通过复制滑移使序列长度增加形成的......”。

6、“.....微卫星序列可能也承受选择压力。但是，对于位于染色体上不同位置的微卫星序列来说，它们所承受的选择压湖南大学毕业设计论文第页力是不同的。在栽培稻中，来源于表达序列中的微卫星序列所拥有湖南大学毕业设计论文第页目录绪论,简单重复序列,简单重复序列的概念,简单重复序列的起源与进化简单重复序列的分类简单重复序列产生的机制及其影响因素简单重复序列的应用简单重复序列序列相似性比较和同源性分析,烟草花叶病毒几种烟草花叶病毒的介绍烟草花叶病毒番茄花叶病毒黄瓜绿斑驳花叶病毒芜菁花叶病毒实验部分材料和方法基因组序列材料分析方法分析常用的软件介绍的相关介绍的相关介绍的相关介绍结果与分析简单重复序列分布的总体概况相对丰度与相对密度相对丰度,相对密度,基因组各基序重复频率与最长基序......”。

7、“.....基因组中最长的基序,对序列比对,进化树的概念,对序列比对的分析方法,对序列比对的结果与分析,结论致谢参考文献,湖南大学毕业设计论文第页绪论生物信息学是世纪年代末，随着人类基因组计划的不断发展，基因序列和蛋白湖南大学毕业设计论文第页湖南大学毕业设计论文第页注括号中的数字表示每种重复基序或重复基序组合总的出现次数。基因组中出现频率最高的基序不同的重复基序在生物体基因组中出现的频率是不同的。从上述可见，不论含量的高低，重复基序相对于重复来说都占绝对的优势。在型中，大多数以，重复基序为主。其中病毒中基序重复次数为，其次为和病毒中基序重复次数为二型中重复次数最多基序为病毒中的和基序，重复次数分别为和次。其次为病毒基因组中的基序重复次数为次三型在供分析的种病毒中以为主，其中最......”。

8、“.....根据进化树不仅可以研究从单细胞有机体到多细胞有机体的生物进化过程，而且可以粗略估计现存的各类种属生物的分歧时间。通过蛋白质的分子进化树分析，为从分子水平研究物种进化提供了新的手段，可以比较精确的确定物种的进化地位。对于物种分类问题，蛋白质的分子进化树亦可作为个重要的依据。构建进化树的方法包括两种类是序列类似性比较，主要是基于氨基酸相对突变率矩阵常用计算不同序列差异性积分作为它们的差异性量度序列进化树另类在难以通过序列比较构建序列进化树的情况下，通过蛋白质结构比较包括刚体结构叠合和多结构特征比较等方法建立结构进化树。多序列比对的分析方法将上述种烟草花叶病毒基因组序列在软件中的程序进行处理，方法如下打开程序，点击输入新序列全部输入种序列后点击，如下图......”。

9、“.....湖南大学毕业设计论文第页点击，观察进化树。图软件分析的进化树结果注进化树见上图，由上到下顺序依次为。树枝的长度反映当这些事件发生时就存在的蛋白质与现在的蛋白质之间的进化距离。根据进化树不仅可以研究从单细胞有机体到多细胞有机体的生物进化过程，而且可以粗略估计现存的各类种属生物的分歧时间。树枝越短，两者亲缘关系越近。湖南大学毕业设计论文第页之后再将序列比对结果复制于文件中，用红色标出每种病毒的简单重复序列，紫色标出空隙便于识别。结果与构建出的进化树进行对比，观察种病毒基因的简单重复序列相似性。将具有相似型的区域数量统计至表，由于序列比对结果过多，在此就不列举了。本文选出了个具有代表性的结果进行分析。多序列比对的结果与分析图是种烟草花叶病毒基因组在碱基左右处的分布情况，由此可见与在此区域的分布基本相同......”。