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疱疹病毒中简单重复序列的分布初探_硕士毕业论文设计 疱疹病毒中简单重复序列的分布初探_硕士毕业论文设计

格式:word 上传:2022-06-25 08:31:27

《疱疹病毒中简单重复序列的分布初探_硕士毕业论文设计》修改意见稿

1、“.....进化过程中不同物种的错配修复系统是有所差异的,他们对不同序列类型的错配有着不同的修复效率。这可能就是造成不同物种中不同简单重复序列的丰度各不相同的主要原因。简单重复序列之所以引起人们的广泛关注,是因为能提供大量的分子标记在基因组的进化中具有重要作用影响基因的表达和调控物种尤其是亚种之间基因组研究和遗传分析。简单重复序列可能在卫星序列的形成初期具有重要的作用。有些小卫星序列基本单位的组成部分是由简单重复序列构成的。简单重复序列的研究情况简单重复序列在基因组水平上被广泛研究,在真核生物与原核生物中发现了很多简单重复序列的特性简单重复序列在基因组中的分布并不是任意的基因组中,大多数的简单重复序列都很丰富而且普遍存在着,简单重复序列的多少与基因组的大小并不总是正相关简单重复序列出现在端,端,内含子,外显子中由于重复次数的不同及重复程度的不完全......”

2、“.....修复或重组过程中产生滑移所引起的。简单重复序列的多态性,高度的可变性和侧翼序列的相对保守性,般在遗传上表现为共显性,其数量和种类对翻译活动水平的高低还可能具有定的影响。简单重复序列有高度的可变性与高度的多态性,因而广泛用于遗传标记简单重复序列类型可能是在不同的类群不同或者在相同的类群区分不同的区域简单重复序列被认为能够影响翻译的活性,可能在基因调控的进化过程中引起重要作用简单重复序列越长,它整体重复单元的突变率可能越高。目前,对病毒简单重复序列的研究还非常的少,而针对疱疹病毒简单重复序列的研究更是缺乏,本文就是针对疱疹病毒科的种病毒属进行了分析研究。在疱疹病毒中我们研究简单重复序列的相对丰度,相对密度以及三型简单重复序列中碱基的分类情况。在进化过程中,简单重复序列可能也承受选择压力。但是......”

3、“.....在这里领略到了数据的力量。在各位师兄师姐的帮助下,使得我在短时间理就掌握了很多的数据分析方法与技巧,这为我进步的分析打下了坚实的基础,再次向他们表示我最真挚的谢意。毕业设计论文年月日设计论文题目疱疹病毒中简单重复序列的分布初探学生姓名学生学号专业班级生物技术班学院名称生物学院指导老师学院院长湖南大学毕业设计论文第页疱疹病毒中简单重复序列的分布初探摘要本文以种疱疹病毒的基因组序列作为研究材料,利用软件分析了各个基因组序列中的的分布情况,结果显示各个基因组中的含量并没有随着基因组的长度增大而增大,各个基因组中单核苷酸,二核苷酸以及三核苷酸重复的相对丰度明显高于四核苷酸五核苷酸和六核苷酸重复。另外我们还分析了三核苷酸重复在种疱疹病毒中的分布情况,结果显示不同的疱疹病毒呈现出不同的分布情况,值得提出的是在疱疹病毒和中都存在型的偏向性......”

4、“.....在翻译区中的三核苷酸重复偏向性可能与蛋白质的结构和功能有关。通过对种疱疹病毒基因组序列中的分析,希望能够帮助大家更好的了解疱疹病毒的基因组结构以及的相关功能,同时也希望能够为研究疱疹病毒的变异情况及其致病机制提供相关参考。关键词简单重复序列,疱疹病毒湖南大学毕业设计论文第页,带状疱疹病毒巨细胞病毒人类疱疹病毒型人类疱疹病毒型实验部分材料和方法材料方法相关介绍的相关介绍结果与分析简单重复序列在各基因组中的总体分布情况相对丰度相对密度不同类型三核苷酸重复在疱疹病毒中的分布情况结论致谢参考文献湖南大学毕业设计论文第页绪论简单重复序列简单重复序列,也简称为微卫星序列或者短串联重复序列是指以少数几个核苷酸般是个为单位串联重复的序列,分为型,二型,三型如,四型如,五型如,六型如,其中代表重复的次数。根据简单重复序列的结构,将其分为类......”

5、“.....完全的简单重复序列是指由连续的重复单元构成的简单重复序列不完全的简单重复序列是指重复序列中间有个以下的非重复碱基,两侧连续的重复单元重复数大于复合的简单重复序列则指两类或两类以上的串联重复单位由个连续的非重复的碱基分隔开,但连续的重复单元的重复数不小于。简单重复序列的产生和进化机制简单重复序列是在分子水平上研究物种起源和进化最有效果的手段之。几乎所有的生物基因组都含有本物种或者基因组特异重复序列。简单重复序列的起源,般认为是由于原简单重复序列在局部遗传信息链的复制过程中,出现滑移现象而使序列在长度上产生变化所形成的,而原简单重复序列则可能来源于基因组序列中碱基单元的随机点突变。虽然从复制滑移假说角度看,在物种的进化过程中应该可以产生较长的简单重复序列。但是,事实上生物体内存在的简单重复序列并不能无节制的延伸。种间相关对比研究显示,在漫长的进化过程中......”

6、“.....般都维持在定的长度范围内。有些研究者推测简单重复序列的长度及其分布是在漫长的进化过程中由于简单重复序湖南大学毕业设计论文第页列的复制滑移和随机点突变共同作,湖南大学毕业设计论文第页目录绪论简单重复序列简单重复序列的产生和进化机制简单重复序列的研究情况简单重复序列的突变机制简单重复序列的功能简单重复序列的应用疱疹病毒几种疱疹病毒的简单介绍单纯疱疹病毒水痘们计算出了各种类型的相对丰度,具体分析结果被呈现在表二中,从表二我们可以看出在种疱疹病毒中型二型三型相比四型五型六型来说明显比较多,出现这种现象的原因可能是因为四型五型六型的存在比较大的变异,导致其不能稳定存在。另外从表二也可以看出在种疱疹病毒中,二型的相对丰度比较接近,而型的波动性最大,相比种疱疹病毒中型的相对丰度,最多的是,最少的是,其分布范围是。遗憾的是......”

7、“.....可能是因为分析的病毒种数比较少。表相对丰度编号相对丰度注表中显示的是每中的各碱基的相对丰度值。例如是,基因组总长度是,型为个,型相对丰度值,二三四五六型的相对丰度值计算同前。计算得,的二三四五湖南大学毕业设计论文第页六型的相对丰度值分别为。表中以斜杠为分割。相对密度从表三中我们可以看出的相对密度值分布在之间。相对密度值最少的来自于,相对密度值最多的来自于。这组的相对密度值的平均值为,其中的相对密度值与平均值最接近。相对密度的不同展现出了在各个基因组中的重复次数可能不同,而重复次数越多的在基因组中是不稳定的,容易变异,变异可能会影响基因组的整体结构,导致基因编码出来的蛋白质发生变化。表相对密度编号相对密度注表中显示的是每中的各碱基碱基长度总和的相对密度值。例如是,总长度是,碱基长度总和为,的相对密度值为......”

8、“.....我们把三型中三个碱基重复序列根据碱基的排湖南大学毕业设计论文第页结论本实验通过对种疱疹病毒基因组序列中的简单重复序列进行研究,我们发现了疱疹病毒中简单重复序列的些独特的分布情况。疱疹病毒的基因组大小与简单重复序列的数量似乎没有直接的关系,并没有基因组的数量越大,而相应的简单重复序列的数量越多疱疹病毒的相对丰度的大小与简单重复序列数量有关,简单重复序列的数量越大,对应的相对丰度的数值就越大相对密度的不同,展现了在各个基因组中的重复次数可能不同,而重复次数越多的在基因组中是不稳定的,变异可能会影响基因组的整体结构,导致基因编码出来的蛋白质发生变化般情况下,疱疹病毒中型,二型和三型的相对丰度数值大,而其他型的相对丰度值小,其中有些五型......”

9、“.....这种三核苷酸偏向性可能与蛋白质的结构和功能有关。湖南大学毕业设计论文第页致谢本论文是在湖南大学生命科学与技术研究院的谭钟扬老师的悉心指导下完成的。从论文的选题,以及数据的整理,筛选到论文的撰写,导师都给了我极大的指导和帮助。导师严谨的研究精神,渊博的专业知识与敬业的工作态度都使我受益匪浅。在庞大的数据面前,谭老师带着我分析,去理解发掘所需要的信息,在绝望时为我指明了方向。谭老师在学习上,在科研上,甚至在精神上都给予了我极大的关心及帮助。在此谨向谭老师表示我最衷心的感谢,在研究期间,湖南大学生命科学与技术研究院的师兄与师姐也给予了我巨大的帮助,是他们列总共可以分为种。以每种作为组我们把它分为,来进行核算。这种分类方法来源于因为考虑到种病毒的分析结果表比较多,所以只列出个表,其他表格全部省略,但是结果我们都展现出来了......”

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