1、“.....推断其感染时间分别为抗体初筛有反并理论对随访感染者的基因序列进行系统进化分析，推断感染时间，有助于评估新报告病例的新发感染发生水平和特征。本研究存在定的应用局限性需要对感染者进行随访且至少获得个采样时间点的样本，并经扩增获得随访样本基因序列。用病例感染早期的序列信息来推断病毒起源时间或感染时间会更精确，方法抗体检测抗体筛查试验采用雅培化学发光生物梅里埃北京万泰抗原抗体检测试剂确证试验采用上海英旻泰公司抗体检测试剂。随访抗体检测结果不确定病例每周随访次，随访至感染确证。确证后例感染者基因进化和感染时间推断研究论文全文选择压力等多重因素导致了其进化动态特征。基因体内进化速率为替换核苷酸年，而基因为替换核苷酸年，。本研究例病例的基因片段进化速率为替换核苷酸年，略低于等报道的群体水平基因区进化速率替换核苷酸年......”。

2、“.....个提示感染年，个提示感染年，个提示感染不到年，。本研究中感染年后，细胞计数仍维持在个以上。但些疾带型，处于急性期期，推断分别在抗体初筛有反应前个月个月和个月感染。该结果基本符合急性期感染实验室检测周期特征，可认为该方法能推断感染时间。用该方法对初检即确证的和进行进化分析，推断其感染时间分别为抗体初筛有反应前个月年月和个月年月，为慢性感染者。除以外的例感染者均可以被认为是新发感染病例年内发生的感染并确证。的感染时间与抗体初筛有反应时间间隔偏长个月，可能与其感染的病毒毒株自身特征感染后免疫反应引起血清学指标变化疾病进展过快有关。为蒙初检即确证病例感染时间分别为抗体初筛有反应前个月和前个月。结论运用贝叶斯合并理论分析感染者基因进化情况，可大致推断感染时间......”。

3、“.....关键词基因进化感染时间艾滋病艾滋病病毒贝叶斯合并理论些感染者早期无症状或症状不典型，传播具有隐匿性。年我国新报告艾滋病病毒感染者和艾滋病患者万例，估计当年新发感染万例，其中约的新报告病例为既往感染病例。准确判定新发现病例的感染时间，对了解艾滋病流行趋势制订和实施艾滋病防控策略具有重要感染者于年月日抗体初筛有反应抗体不确定，带型为，天后随访检测带型为全条带。确证后首次细胞计数为个。感染者于年月日人群随访检测抗体初筛阴性。月日随访检测抗体初筛有反应带型为，报告为抗体不确定。例感染者基因进化和感染时间推断研究论文全文。摘要目的研究未接受抗反转录病毒治疗的感染者基因进化特征，并用贝叶斯合并理论推断感染时间，为艾滋病疫情评估提供依据。方法，运行次计算，计算每例随访感染者的最近共同祖先株形成时间，较高后验密度区间......”。

4、“.....根据值计算感染时间。舍弃的运算结果，采用软件解析并构建最大可信，进化树，并用软件解读，后验概率值为可靠的进化簇，。结果例感染者随访及筛查情市以外户籍。其中例经男男性行为，感染，例经异性性行为感染。例抗体初筛有反应抗体不确定，且随访检测呈现进展性免疫印迹，带型，为急性期期例初次检测即确证抗体阳性，且此前个月内未接受过抗体筛查。采样时间跨度为个月至年，每例感染者有个采样时间点。感染者和随访超过年，前例的细胞计数维持在个以上。见表。例感染者感染时间推断例感染者基因片段构建的进访检测带型为全条带。确证后首次细胞计数为个。感染者于年月日人群随访检测抗体初筛阴性。月日随访检测抗体初筛有反应带型为，报告为抗体不确定。贝叶斯合并理论分析采用软件处理比对后的基因片段序列，赋值样本采集时间，设臵松弛型分子钟模块，用马尔科夫链蒙特卡洛方法......”。

5、“.....计算每例次级进化簇后验概率值为。例急性期感染者携带传播性耐药突变突变，并表现出快速疾病进展和准种病毒变异特征。推断例急性期感染者的感染时间为抗体初筛有反应前个月例初检即确证病例感染时间分别为抗体初筛有反应前个月和前个月。结论运用贝叶斯合并理论分析感染者基因进化情况，可大致推断感染时间，有助于艾滋病疫情形势研判。关键词基因进化感染时间艾滋病艾滋病病毒贝叶斯合并理论些感染者早期无症状或症状不典型，传播具有隐匿性。年我国新报告艾滋病病毒感染者和艾滋病患者万例例感染者基因进化和感染时间推断研究论文全文况例感染者均为男性，年龄为岁。除和外，其他例为北京市以外户籍。其中例经男男性行为，感染，例经异性性行为感染。例抗体初筛有反应抗体不确定，且随访检测呈现进展性免疫印迹，带型，为急性期期例初次检测即确证抗体阳性......”。

6、“.....采样时间跨度为个月至年，每例感染者有个采样时间点。感染者和随访超过年，前例的细胞计数维持在个以上。见的感染时间为年月，距年月抗体初筛有反应个月的感染时间为年月，距年月抗体初筛有反应个月。的感染时间为年月，距年月抗体初筛有反应个月。的感染时间为年月，距年月抗体初筛有反应个月。例感染者基因进化和感染时间推断研究论文全文。贝叶斯合并理论分析采用软件处理比对后的基因片段序列，赋值样本采集时间，设臵松弛型分子钟模块，用马尔科夫链蒙特卡洛方法但在泰国的感染者研究中未发现此现象。因此，对新发感染的判定或晚发现病例的分类宜结合病毒亚型和疾病进展综合判断。贝叶斯合并理论般用于地区群体水平毒株的流行趋势评估和传入时间分析而较少用于个体感染时间推断和进化分析，。本研究运用贝叶斯合并理论对随访感染者的基因序列进行系统进化分析......”。

7、“.....有助于评估新报告病例的新发感染发生水平和特征。本研究存在定的应用局限性需要对感染者进行随访且至少获得个采样时间点的样本，并经扩增获得随访样本基因序列。用病例感染早期的序列信息树见图。感染者不同采样时间点获得的序列各自形成个独立的次级进化簇，后验概率值为。感染者与参考株收录号起形成大单系进化簇。感染者与亚型毒株收录号聚集成大单系进化簇，后验概率值为。感染者和分别与收录号和收录号参考株聚集成大单系进化簇，后验概率值均为。贝叶斯合并理论分析个病例体内基因进化速率为替换核苷酸年。推测感染者的感染时间为年月，距年月抗体初筛有反应个月访感染者的最近共同祖先株形成时间，较高后验密度区间，及基因进化速率，根据值计算感染时间。舍弃的运算结果，采用软件解析并构建最大可信，进化树，并用软件解读，后验概率值为可靠的进化簇，......”。

8、“.....年龄为岁。除和外，其他例为北京估计当年新发感染万例，其中约的新报告病例为既往感染病例。准确判定新发现病例的感染时间，对了解艾滋病流行趋势制订和实施艾滋病防控策略具有重要意义。目前推断感染时间常用的方法是捕获酶联免疫法和限制性抗原亲和力酶联免疫法，但这两种方法只能用于估计群体新发感染水平，不能用于个体诊断，且易受到抗病毒治疗机体免疫水平和检测样本保存质量等因素影响，限制了在临床诊疗研究中的应用。感染者于年月日抗体初筛有反应抗体不确定，带型为，天后随推断病毒起源时间或感染时间会更精确，摘要目的研究未接受抗反转录病毒治疗的感染者基因进化特征，并用贝叶斯合并理论推断感染时间，为艾滋病疫情评估提供依据。方法募集例未接受抗反转录病毒治疗的感染者，定期随访并采集血样，用法扩增基因片段......”。

9、“.....构建最大可信进化树，推测其最近共同祖先株形成时间，进而推断感染时间。结果例感染者均为男性，年龄为岁。每例感染者有个采样时间点，其基因序列各自聚集成个独立的例感染者基因进化和感染时间推断研究论文全文计数通常是晚发现病例的判断依据细胞个提示感染年及以上，个提示感染年，个提示感染年，个提示感染不到年，。本研究中感染年后，细胞计数仍维持在个以上。但些疾病进展较快的感染者细胞计数下降较快，如于感染后的早期阶段个月维持较低的细胞水平，属于疾病进展较快的免疫反应。有研究显示我国毒株感染者的疾病进展较快，例急性期病例中有例在随访半年内细胞计数快速降至个以下前个月年月和个月年月，为慢性感染者。除以外的例感染者均可以被认为是新发感染病例年内发生的感染并确证。的感染时间与抗体初筛有反应时间间隔偏长个月......”。