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基于趋磁细菌多样性进行济南冬季泉水水系分析(微生物学论文) 基于趋磁细菌多样性进行济南冬季泉水水系分析(微生物学论文)

格式:word 上传:2023-05-06 00:25:06

《基于趋磁细菌多样性进行济南冬季泉水水系分析(微生物学论文)》修改意见稿

1、“.....在趋磁细菌长期演化过程中扮演重要角色,因此认识不同季节不同天然条件下趋磁细菌的分布就引起人们广泛的兴趣。前人研究揭示,在河流湖泊海洋等常见水体及以盐碱湖和热泉为代表的极端环境中趋磁细菌都具有复杂的生物多样性,且种类的分布与环境因子体现出明显相关性,。目前还未见有关趋磁细菌在冬季泉水这种寡营养水体环境中的生物多样性研究。本试验即以冬季寡营养的济南天然泉水水系为研究对象,分析趋磁细菌的分布以及细菌和磁小体的形态深海趋磁细菌研究微生物学杂志,王浩然,张连越,刘沛余济南冬季泉水水系中趋磁细菌的多样性山东农业科学,基金大连星海古生物化石博物馆小科学家百人计划项目。基于趋磁细菌多样性进行济南冬季泉水水系分析微生物学论文。图大明湖和黑虎泉趋磁细菌和磁小体的透射电子显微照片,代表富集检测到的种不同的趋磁细菌及其磁小体的形态。数字......”

2、“.....磁小体形态。图黑虎泉和大明湖水体中收集到的趋磁细菌磁小体电子显微学分析不同基于趋磁细菌多样性进行济南冬季泉水水系分析微生物学论文在大于后随着长度的增加形状因子逐渐减小,这与前人研究中提出的子弹头型磁小体的生长模式接近。同时,我们也获得了与相似度极高的序列相似度,因此推测大明湖中合成子弹头型磁小体的趋磁杆菌很有可能与为同菌株。本试验的个取样点中,我们仅从大明湖的个点黑虎泉下游的个点中分离到趋磁细菌,但这些取样点的主要细菌种类相同,仅丰度有差异,推测可能是环境中微生物群落的变化影响了趋磁细菌的分布。下步,我们将深入探索不同泉水样品的化学元素组城河中发现了少量趋磁细菌,为暂定η变形菌纲的个,多为单链趋磁细菌大明湖中趋磁细菌种类与数据最为丰富,无论磁小体链的条数形态还是单个磁小体的形态,都具有明显的多样性。暂定η变形菌纲是最近才确立的个新的趋磁细菌分类单元......”

3、“.....结合系统发育树和透射电子显微镜照片,我们初步推测观察到的球菌可能属于暂定η变形菌纲。除球菌外,大明湖中还发现了株杆菌,该趋磁细菌可以形成多束磁小体链,磁小体链呈子弹头状,而这些特征位相连法构建系统发育进化树,引导程序重复计算千次。济南泉水水系中主要细菌群落是变形菌门蓝细菌门和绿弯菌门,者总丰度均占细菌总量的以上图。其中,龙潭样品中蓝细菌门丰度最高,占总细菌丰度的。黑虎泉与大明湖中蓝细菌门和变形菌门丰度相似,均占细菌总丰度的。珍珠泉水系微生物丰度与其它样品差距较大,其丰度最高细菌为变形菌门,其次为绿弯菌门,而蓝细菌门含量相对较少。由于这次从冬季泉水中分离获得的趋磁细菌主要是变形菌门图,而趋磁细菌要形成相关竞争将产物稀释为相同浓度,然后使用焦磷酸测序仪进行测序。扩增上下游引物分别为和。扩增条件为,随后变性,复性,延伸,进行个循环,最后延伸......”

4、“.....扩增后的序列使用琼脂糖凝胶电泳法进行分离并使用胶回收试剂盒进行纯化。纯化产物用载体连接试剂盒,日本连接到载体上,然后体形态主要表现为长方体和子弹头状,也展示了较多的形态。其中在大明湖和黑虎泉下游护城河优势菌株的磁小体为单链图,图,说明磁小体链条数较少,其能量代谢负担要小,因而易形成优势种群。基于趋磁细菌多样性进行济南冬季泉水水系分析微生物学论文。透射电子显微镜观察及分析将收集到的趋磁细菌细胞离心后去上清,加入水重悬后,重复洗涤次后浓缩至。取约趋磁细菌细胞悬浊液滴到铜网上,待完全干燥后使用显微镜和扩增进行测序。并使用软件来控制数据质量,包括进行长度的筛选和低质量序列的过滤,舍弃长度不足的序列。趋磁细菌系统发育树的构建使用算法将长度和质量达标的序列进行对齐和排序处理,处理结果再利用软件,通过临位相连法构建系统发育进化树,引导程序重复计算千次......”

5、“.....加入推测趋磁细菌的分布与环境因子有定相关性,但还需要进步深度分析。参考文献肖天,潘红苗,张文燕深海趋磁细菌研究微生物学杂志,王浩然,张连越,刘沛余济南冬季泉水水系中趋磁细菌的多样性山东农业科学,基金大连星海古生物化石博物馆小科学家百人计划项目。基于趋磁细菌多样性进行济南冬季泉水水系分析微生物学论文。将产物稀释为相同浓度,然后使用焦磷酸测序仪进行测序。扩增上下游引物分别为着大明湖中的双链球菌可能来自不同的菌株。子弹头状磁小体在长度小于时形状因子分布在左右,在大于后随着长度的增加形状因子逐渐减小,这与前人研究中提出的子弹头型磁小体的生长模式接近。同时,我们也获得了与相似度极高的序列相似度,因此推测大明湖中合成子弹头型磁小体的趋磁杆菌很有可能与为同菌株。本试验的个取样点中,我们仅从大明湖的个点黑虎泉下游的个点中分离到趋磁细菌......”

6、“.....仅丰度有差异,推测可能基于趋磁细菌多样性进行济南冬季泉水水系分析微生物学论文日本东京进行透射电子显微学分析。基因组提取及序列扩增用土壤提取试剂盒,美国提取泉水表层泥样中的总基因组,基因组的纯度和浓度用分光光度计,测定,并且在之间。使用条码融合探针和覆盖高变区扩增基和覆盖高变区扩增基因。表获得的序列注所有序列均已提交数据库。大明湖泥样的趋磁细菌形态分析进步通过透射电子显微镜分析获得的未培养趋磁细菌及磁小体的分布与形态。图展示观察到的株不同趋磁细菌,其中球菌株杆菌株。济南泉水水系中磁小体在菌体中排列方式多样,有单链双链多链束状和分散排列等形式,这些排列方式与已报道的方式基本致而磁小水系中趋磁细菌分布,发现泉水的源头黑虎泉珍珠泉龙潭处并没有检测到趋磁细菌,而在黑虎泉下游护城河中发现了少量趋磁细菌,为暂定η变形菌纲的个......”

7、“.....无论磁小体链的条数形态还是单个磁小体的形态,都具有明显的多样性。暂定η变形菌纲是最近才确立的个新的趋磁细菌分类单元,代表性的纯培养微生物均为趋磁球菌,结合系统发育树和透射电子显微镜照片,我们初步推测观察到的球菌可能属于暂定η变形菌纲。除球菌水重悬后,重复洗涤次后浓缩至。取约趋磁细菌细胞悬浊液滴到铜网上,待完全干燥后使用显微镜,日本东京进行透射电子显微学分析。基因组提取及序列扩增用土壤提取试剂盒,美国提取泉水表层泥样中的总基因组,基因组的纯度和浓度用分光光度计,测定,并且在之间。使用条码融合探和。扩增条件为,随后变性,复性,延伸,进行个循环,最后延伸。为了纯化产物,扩增后的序列使用琼脂糖凝胶电泳法进行分离并使用胶回收试剂盒进行纯化。纯化产物用载体连接试剂盒,日本连接到载体上,然后转化到大肠杆菌感受态细胞天根,中国中。随机挑选百个克隆......”

8、“.....下步,我们将深入探索不同泉水样品的化学元素组成和差异,以及不同季节不同取样深度等泉水中微生物群落和趋磁细菌的差异,并进步深度测序宏基因组,找出泉水中趋磁细菌分布与环境因子的内在关联性。综上所述,济南冬季泉水水系中趋磁细菌分布差异较大,仅在黑虎泉下游护城河和大明湖中发现趋磁细菌,其中黑虎泉下游护城河中的趋磁细菌量少且仅为η变形菌纲的个,而大明湖中趋磁细菌种类繁多且细菌和磁小体形态多样性外,大明湖中还发现了株杆菌,该趋磁细菌可以形成多束磁小体链,磁小体链呈子弹头状,而这些特征均是硝化螺菌门趋磁细菌的典型特点,因此我们推测该细菌可能属于硝化螺菌门。值得注意的是,是个从未发表过的全新序列,可能代表了暂定η变形菌纲的个新种。进步分析磁小体大小和形态发现,单链球菌链球菌的磁小体大小和形状因子均比较集中,因此......”

9、“.....而双链球菌的磁小体形状因子分布范围较大,这意基于趋磁细菌多样性进行济南冬季泉水水系分析微生物学论文相对较少。由于这次从冬季泉水中分离获得的趋磁细菌主要是变形菌门图,而趋磁细菌要形成相关竞争,需要有定的氧气浓度,因此可进行光合作用的合适比例的蓝细菌门细菌可能是其形成相对优势菌的菌落基础图。图冬季济南处泉水水系微生物群落测序分析稀释曲线稀释曲线样本与微生物物种的共线性关系相关样本微生物种类丰度。讨论与结论自然界中趋磁细菌资源丰富种类繁多,在地球生物化学元素循环尤其是铁和硫的代谢中发挥重要作用。本研究通过比较济南市冬季不同泉多样性,揭示不同区域泉水的微生物多样性,为进步研究趋磁细菌与环境微生物群落之间的关系奠定基础。图大明湖和黑虎泉趋磁细菌和磁小体的透射电子显微照片,代表富集检测到的种不同的趋磁细菌及其磁小体的形态。数字......”

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