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基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用(新型冠状病毒论文) 基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用(新型冠状病毒论文)

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《基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用(新型冠状病毒论文)》修改意见稿

1、“.....魏贤文新型冠状病毒治疗药物体内外研究及药物研发进展病毒学报,国家药典委员会中。相比较而言,可能靛蓝的结合力较靛玉红更大。所有氢键的形成也是这些复合物结合过程中的个重要因素。两个体系形成的氢键均为配体中的含氮含氧基团与蛋白残基之间的氢键,表明配体的含氮和含氧基团蛋白活性残基为形成氢键的关键部分。中药治疗作用存在多靶点多环节整体调节的特点,在治疗发病机制复杂的传染性疾病中发挥着独特作用。在新型冠状病毒肺炎的防治中,国家卫生健康委员会在不断更新的新型冠状病毒肺炎诊疗方案中也强调了中医药的应用,提出病因为感受疫戾之气。从试行第版开始明确提出中医药的具体治疗方案及具体药物。中国药典记载青黛有清热解毒之间形成氢键疏水作用,并得到了结合最佳构象。由于分子对接技术体现的是配体与受体的静态作用,因此进步完成了分子动力学模拟验证配体与受体复合物的结合情况。采用模拟了的分子动力学......”

2、“.....用计算各配合物的总自由能。自由能计算和氢键分析可以很好地阐明小分子配体与之间的结合模式。结果表明,这两个体系的主要作用力是静电相互作用范德华力,以及非极性溶剂化自由能。在靛蓝的分子动力学模拟过程中观察到范德华力的绝对值大于非极性溶剂化相互作用和静电相互作用的绝对值。可见,范德华力在靛蓝与的相基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用新型冠状病毒论文结合囊结构图图靛玉红与结合囊结构图靛蓝和受体复合物模拟结合时总结合自由能为,其中气相自由能为,溶剂化自由能为。对结合过程起促进作用的有范德华作用力,静电相互作用,非极性溶剂化能。对结合过程起抑制作用的是极性溶剂化能。靛玉红和受体复合物模拟结合时总结合自由能为,其中气相自由能为,溶剂化自由能为。对结合过程起促进作用的有范德华作用力,静电相互作用,非极性溶剂化能......”

3、“.....可见,靛蓝与受体复合物结合过程中,范德华作用对体系结合的贡献要大于静电作用非极性溶剂化能靛玉红与受体结合过程中,子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用。方法从蛋白晶体结构数据库中医药资料库获取受体晶体结构配体小分子结构。基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用新型冠状病毒论文。结果分子对接结果分析通过分子对接技术,可知靛蓝与对接的自由能最低值为靛玉红与对接的自由能最低佳为并且获得对接最佳构象。如图。注靛蓝与对接最佳构象靛玉红与对接最佳构象。图对接最佳构象示意图靛蓝与对接形成个氢键,与配体形成氢键的残基是设为格点中心为盒子大小为格点间距其他参数默认。应用计算格点能量,对接运算采用拉马克遗传算法。基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用新型冠状病毒论文。年月日,将该病毒命名为......”

4、“.....研究报道,血管紧张素转换酶是引起该病严重流行的新型冠状病毒的细胞受体。虽然新型冠状病毒肺炎死亡率并不显著高于般病毒性肺炎,但其人传人无症状携带者即可传播的特点,使疫情在全球范围内迅速蔓延。因此,寻找副作用小摘要目的探究基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用。方法从蛋白晶体结构数据库中医药资料库获取受体晶体结构配体小分子结构。青黛在中医临床上的应用可追溯到余年前。中国药典记载青黛的主要有效成分是靛蓝和靛玉红。现代研究表明,青黛具有抗炎抗菌抗病毒调节免疫抗肿瘤等多种药理活性。有实验研究报道,靛蓝可通过下调的表达起到定的体外抗炎作用。靛玉红可通过调节通路发挥抗病毒作用,有下调炎症因子表达减轻病毒继发性肺炎等药理作用。签于此,本研究基于分子对接技术及分子动力学模拟预测青黛的两个主要有效成分靛蓝靛的......”

5、“.....参考文献管汉雄,熊颖,申楠茜,等武汉新型冠状病毒肺炎的临床影像学特征初探放射学实践,宋杲,成梦群,魏贤文新型冠状病毒治疗药物体内外研究及药物研发进展病毒学报,国家药典委员会中华人民共和国药典部北京中国医药科技出版社,高凤洋,张大方,李超英中药青黛炮制及药理作用的研究进展长春中医药大学学报,刘丽娟,王允亮,李军祥靛蓝对溃疡性结肠炎体外炎症模型的作用中华中医药杂志,揭冲靛玉红调节通路降低流感易感性研究广州暨南大学,尚沛津,李玉文,部分。非极性溶剂化能与溶剂的可极化面积有关,在两个体系中均为负,但均小于范德华力静电作用。非溶剂化自由能可以轻微促进小分子与受体的结合。然而,在两个体系中极性溶剂化的自由能阻碍了小分子和之间的相互作用。靛蓝与总结合自由能为,靛玉红为。相比较而言,可能靛蓝的结合力较靛玉红更大......”

6、“.....两个体系形成的氢键均为配体中的含氮含氧基团与蛋白残基之间的氢键,表明配体的含氮和含氧基团蛋白活性残基为形成氢键的关键部分。中药治疗作用存在多靶点多环节整体调节的特点靛蓝与受体复合物结合囊区域残基形成个主要氢键,占比分别为,形成靛玉红与受体复合物结合的主要原因。见表表。表靛蓝与的氢键相互作用表靛玉红与的氢键相互作用讨论分子对接结果表明配体小分子靛蓝靛玉红与的活性位点残基之间形成氢键疏水作用,并得到了结合最佳构象。由于分子对接技术体现的是配体与受体的静态作用,因此进步完成了分子动力学模拟验证配体与受体复合物的结合情况。采用模拟了的分子动力学。分子动力学模拟平衡后,用计算各配合物的总自由能。自由能计算和氢键分析可以很好地阐明注为靛蓝与对接模式分析为靛玉红与对接模式分析代表链,即病毒蛋白。代表链,即......”

7、“.....如图图。图靛蓝与结合囊结构图图靛玉红与结合囊结构图靛蓝和受体复合物模拟结合时总结合自由能为,其中气相自由能为,溶剂化自由能为。对结合过程起促进作用的有范德华作用力,静电相互作用,非极性溶剂化能。对结合过程起抑制作用的是极性溶剂化能。靛玉红和受体复合物模拟结合时总结合自由基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用新型冠状病毒论文张恺,等中药药效物质基础的研究进展中国药房,国家卫生健康委办公厅国家中医药管理局办公室新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案试行第版天津中医药,冯耀文中药内服外敷治疗流行性腮腺炎临床观察新中医,帅丽华,胡志坚,李婷,等青黛新萜物质合剂抗高危病毒临床疗效观察实验与检验医学,贾晓丽,程亚娟,苗丽娟青黛内服外涂治疗带状疱疹的疗效观察中国社区医师医学专业,崔伟亮,李慧芬......”

8、“.....戚璐,徐俊,许杰,楼汪洲洋,程良斌基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛对新型冠状病毒肺炎的干预作用中药火,治温毒发斑及产后热痢下重。要药分剂云除热解毒,兼能凉血。开宝本草记载主解诸药毒,小儿诸热,惊痫发热,天行头痛寒热,煎水研服之。现代多项研究表明,青黛作为复方组分或单独应用可用于腮腺炎病毒感染人乳头状病毒感染带状疱疹病毒感染流感病毒感染等疾病。综上所述,数据结果显示青黛的两种主要有效成分靛蓝靛玉红可与结合,且两个体系具有相似的结合模式。结合历代医家青黛临床应用经验,本研究预测青黛可通过干预复合物对新型冠状病毒肺炎起治疗作用。然而,单从分子对接分子动力学模拟探讨青黛对新型冠状病毒肺炎的治疗作用是不够实验与检验医学,贾晓丽,程亚娟,苗丽娟青黛内服外涂治疗带状疱疹的疗效观察中国社区医师医学专业,崔伟亮,李慧芬......”

9、“.....戚璐,徐俊,许杰,楼汪洲洋,程良斌基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛对新型冠状病毒肺炎的干预作用中药材。关键词分子动力学模拟新型冠状病毒肺炎青黛靛玉红年年底爆发的新型冠状病毒肺炎已成为种全球性流行病,严重危害着人类健康。基于分子对接及分子动力学模拟预测青黛在新型冠状病毒肺炎中的干预作用新型冠状病毒论文。结果分子对接结果分析通过分子对接技术,可知靛蓝与,在治疗发病机制复杂的传染性疾病中发挥着独特作用。在新型冠状病毒肺炎的防治中,国家卫生健康委员会在不断更新的新型冠状病毒肺炎诊疗方案中也强调了中医药的应用,提出病因为感受疫戾之气。从试行第版开始明确提出中医药的具体治疗方案及具体药物。中国药典记载青黛有清热解毒,凉血消斑,泻火定惊之功用于温毒发斑血热吐衄胸痛咳血口疮痄腮喉痹小儿惊痫。中医认为引起新型冠状病毒肺炎疫戾之气可归属于温热毒邪范畴......”

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