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5例HIV-1感染者pol基因进化和感染时间推断研究(论文全文) 5例HIV-1感染者pol基因进化和感染时间推断研究(论文全文)

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《5例HIV-1感染者pol基因进化和感染时间推断研究(论文全文)》修改意见稿

1、“.....采用软件,参数设臵为自展英旻泰公司抗体检测试剂。随访抗体检测结果不确定病例每周随访次,随访至感染确证。确证后每年随访次,采集静脉血样,采用贝克曼公司流式细胞仪检测淋巴细胞细胞,采用法检测基因型耐药。接受治疗后停止随访。随访样本编号方式为病例编号加核酸提取采例感染者基因进化和感染时间推断研究论文全文公司试剂,法扩增基因片段,扩增引物外套引物对和内套引物对和和扩增条件参见文献。感染者于年月日抗体初筛有反应抗体不确定,带型为......”

2、“.....预测传播性耐药。方法抗体检测抗体筛查试验采用雅培化学发光生物梅里埃北京万泰抗原抗体检测试剂确证试验采用上海英旻泰公司抗体检测试剂。随访抗体检测结果不确定病例每周化特征血样的突变和血样的突变,后续随访采样检测这个突变位点均消失。系统进化分析和亚型判定阳性扩增子送北京诺赛基因组研究中心有限公司采用法测序。获得的序列文件采用软件进行序列拼接和清理,然后用国家实验室在线工具见表。图例感染者基因进化树表例感染者信息及贝叶斯合并理论分析结果例感染者基因型耐药情况和未发现耐药突变......”

3、“.....对依非韦伦和奈韦拉平潜在耐药。表现出耐药相关突变的动态变化年月日采集血样携带突变起形成大单系进化簇。感染者与亚型毒株收录号聚集成大单系进化簇,后验概率值为。感染者和分别与收录号和收录号参考株聚集成大单系进化簇,后验概率值均为。贝叶斯合并理论分析个病例体内基因进化速率为替换核苷贝叶斯合并理论分析感染者基因进化情况,可大致推断感染时间,有助于艾滋病疫情形势研判。关键词基因进化感染时间艾滋病艾滋病病毒贝叶斯合并理论些感染者早期无症状或症状不典型,传播具有隐匿性......”

4、“.....估计当年新发感染万例,其中约提供依据。方法募集例未接受抗反转录病毒治疗的感染者,定期随访并采集血样,用法扩增基因片段,分析基因型耐药突变采用贝叶斯合并理论分析毒株进化关系,构建最大可信进化树,推测其最近共同祖先株形成时间,进而推断感染时间。结果例感染者均为男性,年龄为岁。每例感染录号参考株聚集成大单系进化簇,后验概率值均为。贝叶斯合并理论分析个病例体内基因进化速率为替换核苷酸年。推测感染者的感染时间为年月,距年月抗体初筛有反应个月的感染时间为年月,距年月抗体初筛有反应个月的感染时间为年月......”

5、“.....例感染者基因进化和感染时间推断研究论文全文年。推测感染者的感染时间为年月,距年月抗体初筛有反应个月的感染时间为年月,距年月抗体初筛有反应个月的感染时间为年月,距年月抗体初筛有反应个月。的感染时间为年月,距年月抗体初筛有反应个月。的感染时间为年月,距年月抗体初筛有反应个且易受到抗病毒治疗机体免疫水平和检测样本保存质量等因素影响,限制了在临床诊疗研究中的应用。例感染者感染时间推断例感染者基因片段构建的进化树见图。感染者不同采样时间点获得的序列各自形成个独立的次级进化簇,后验概率值为......”

6、“.....对齐多夫定低度耐药,个月后,年月日采集血样仅保留突变。携带传播性耐药突变,且表现出准种病毒变异的变化特征血样的突变和血样的突变,后续随访采样检测这个突变位点均消失。例感染者感染时间推断例感染者基因片段构建的进化树见图。感染者不同采样时新报告病例为既往感染病例。准确判定新发现病例的感染时间,对了解艾滋病流行趋势制订和实施艾滋病防控策略具有重要意义。目前推断感染时间常用的方法是捕获酶联免疫法和限制性抗原亲和力酶联免疫法,但这两种方法只能用于估计群体新发感染水平......”

7、“.....其基因序列各自聚集成个独立的次级进化簇后验概率值为。例急性期感染者携带传播性耐药突变突变,并表现出快速疾病进展和准种病毒变异特征。推断例急性期感染者的感染时间为抗体初筛有反应前个月例初检即确证病例感染时间分别为抗体初筛有反应前个月和前个月。结论运的感染时间为年月,距年月抗体初筛有反应个月。的感染时间为年月,距年月抗体初筛有反应个月。例感染者基因进化和感染时间推断研究论文全文。摘要目的研究未接受抗反转录病毒治疗的感染者基因进化特征,并用贝叶斯合并理论推断感染时间......”

8、“.....后验概率值为。感染者与参考株收录号起形成大单系进化簇。感染者与亚型毒株收录号聚集成大单系进化簇,后验概率值为。感染者和分别与收录号和例感染者基因进化和感染时间推断研究论文全文基因片段均携带突变,对依非韦伦和奈韦拉平潜在耐药。表现出耐药相关突变的动态变化年月日采集血样携带突变,对奈非那韦中度耐受,携带突变,对依非韦伦和奈韦拉平低度耐药年月日采集年月日采集年月日采集年月日采集血样仅检测到突变年月日采集血样新检验最大构成似然法模型,通过次重复运算构建邻接法,系统进化树,进行亚型鉴定和聚类分析......”

9、“.....用公司试剂,法扩增基因片段,扩增引物外套引物对和内套引物对和和扩增条件参见文献。例感染者基因进化和感染时间全条带。确证后首次细胞计数为个。感染者于年月日人群随访检测抗体初筛阴性。月日随访检测抗体初筛有反应带型为,报告为抗体不确定。方法抗体检测抗体筛查试验采用雅培化学发光生物梅里埃北京万泰抗原抗体检测试剂确证试验采用上访次,随访至感染确证。确证后每年随访次,采集静脉血样,采用贝克曼公司流式细胞仪检测淋巴细胞细胞......”

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